Virtual E. coli
K-12 MG1655하나로 통합된 속도론 시뮬레이션입니다. 모든 프로세스가 실제 속도 상수를 갖고, 성장률은 단백질 축적에서 창발합니다. 생화학과 효소 속도론에서 제1원리로 구축했습니다. 약 40,000개의 반응·프로세스, 전장 유전체에서 발현되는 4,403개 유전자를 담고 있습니다.
CRISPRi thyA 녹다운/녹아웃으로 Otto et al. 2024, Cell Systems의 상위성(epistasis) 실험 설계를 재현했습니다. 2026년 8월 실제 실행에서 15회 연속 배가, 1 → 32,768 세포를 기록했습니다. 조건별 멀티오믹스를 포함한 더 넓은 검증은 진행 중이며 아직 완료되지 않았습니다.